Для установки пакетов, файлы которых уже существуют в системе (например, файл был записан пакетным менеджером APT, стоит добавить флаг команды --dbonly:

pacman -S --dbonly <package_name>

После проделанной операции возможно потребуется доустановить файлы пакета путем использования команды:

pacman -S <package_name>